來源:生物世界 人體微生物組的重要作用已得到廣泛認(rèn)可。口腔是人體內(nèi)第二大微生物棲息地(僅次于腸道),口腔微生物組多樣性顯著,生態(tài)復(fù)雜,它在維持人體健康和支持生物發(fā)育方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用??谇徊《窘M是口腔微生物組的重要組成部分,主要由噬菌體(感染細(xì)菌的病毒)和真核病毒構(gòu)成。然而,口腔微生物組中的噬菌體在很大程度上為受重視,其作用可能被低估了。 2025 年 9 月 1 日,清華大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院梁冠翔團隊與北京大學(xué)口腔醫(yī)院陳峰團隊合作,在 Cell 子刊 Cell Reports Medicine 上發(fā)表了了題為:Oral virome metagenomic catalog links Porphyromonas gingivalis phages to obesity and type 2 diabetes 的研究論文。 該研究構(gòu)建了人類口腔病毒組數(shù)據(jù)庫(Human Oral Virome Database,HOVD),包含了 24440 個噬菌體病毒操作分類單元(vOTU)和 83 個真核病毒,并利用 HOVD 描述了 2 型糖尿病/肥胖患者口腔病毒組的變化及其與口腔細(xì)菌和腸道病毒組的相關(guān)性。該研究還進一步揭示了口腔噬菌體產(chǎn)生的內(nèi)溶素可抑制口腔致病菌牙齦卟啉單胞菌,為伴 2 型糖尿病牙周炎提供了新的治療方案。 口腔病毒已被確認(rèn)與人類疾病相關(guān),例如口腔癌、牙周病、手足口病,以及類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎等,這表明口腔病毒可能會影響這些疾病的進展,并暗示了基于微生物組構(gòu)成的潛在預(yù)后和診斷方法。在慢性代謝疾病中,2 型糖尿?。═2D)是全球發(fā)病率和死亡率的主要因素,且在快速增長中,導(dǎo)致了巨大的經(jīng)濟和社會后果。而與 2 型糖尿病相關(guān)的人類口腔病毒的變化情況及其在治療和預(yù)測疾病發(fā)展中的潛在作用,我們?nèi)灾跎佟?/P> 在這項新研究中,為了拓展現(xiàn)有的研究并為人類口腔病毒組提供一個補充視角,研究團隊整合了之前發(fā)表的三個口腔病毒組數(shù)據(jù)庫中的口腔病毒基因組,以及從 220 個肥胖患者(有或無 2 型糖尿病)的口腔宏基因組中鑒定出的病毒基因組,進行了大規(guī)模整合。 研究團隊利用這些數(shù)據(jù)建立了人類口腔病毒組數(shù)據(jù)庫(Human Oral Virome Database,HOVD),這是一個可免費訪問的在線資源,其中包含由人類口腔噬菌體數(shù)據(jù)庫(OPD)組成的 24440 個噬菌體病毒操作分類單元(vOTU)和由人類口腔真核病毒數(shù)據(jù)庫(OED)組成的 83 個真核病毒片段,估計完整度超過 50%。 利用 HOVD 數(shù)據(jù)庫,研究團隊描述了 2 型糖尿病肥胖患者口腔病毒組的變化及其與口腔細(xì)菌和腸道病毒組的相關(guān)性,結(jié)果顯示,患有 2 型糖尿病的肥胖患者的口腔病毒多樣性降低,與臨床特征的相關(guān)性較低,病毒-細(xì)菌相關(guān)性受到破壞,口腔-腸道病毒組傳播增強。 此外,研究團隊通過計算鑒定出感染牙齦卟啉單胞菌(Porphyromonas gingivalis)的噬菌體,并篩選出 6 種潛在的內(nèi)溶素(endolysins,噬菌體在感染周期末期產(chǎn)生的一類酶,用于分解細(xì)菌的細(xì)胞壁,從而使子代噬菌體顆粒能夠釋放并感染新的細(xì)菌)。牙齦卟啉單胞菌是牙周炎的主要致病菌之一,并與多種全身性疾?。ɡ缣悄虿?、心血管疾病、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎等)密切相關(guān)。 進一步實驗驗證表明,三種內(nèi)溶素的混合物可顯著抑制牙齦卟啉單胞菌的生長。這些發(fā)現(xiàn)突顯了噬菌體產(chǎn)生的內(nèi)溶素在伴 2 型糖尿病牙周炎中的治療潛力,為口腔和全身疾病干預(yù)提供了途徑。該研究的亮點:人類口腔病毒組數(shù)據(jù)庫(HOVD)在線編目了 24440 種噬菌體操作分類單元和 83 種真核病毒; 肥胖的 2 型糖尿病患者的口腔病毒多樣性降低,臨床關(guān)聯(lián)性較弱;肥胖或 2 型糖尿病會增強口腔-腸道病毒傳播;口腔噬菌體產(chǎn)生的內(nèi)溶素抑制牙齦卟啉單胞菌,為伴 2 型糖尿病牙周炎提供治療方案。 總的來說,這項研究將增進我們對口腔微生物組中鑒定出的病毒以及宿主-病毒相互作用的認(rèn)識,并為人類疾病的診斷和治療提供新線索。